C'est la qualité du substrat rocheux de la plateforme ITER, d'une superficie de 42 hectares, qui a déterminé l'emplacement exact du complexe tokamak. Cette installation de 360 000 tonnes, dans laquelle les expériences de physique seront réalisées à compter de 2020, constitue l'élément central du programme ITER. Le complexe tokamak se composera de trois bâtiments : le tokamak proprement dit, le système de diagnostics et l'installation tritium.

Le complexe tokamak sera niché au cœur de la fosse d'isolation sismique, profonde de 17 mètres, longue de 130 mètres et large de 90. Cet espace a été creusé pour recevoir le radier en béton et les 493 plots parasismiques qui protégeront les bâtiments et les équipements contre les mouvements du sol en cas d'événement sismique.

Les plots parasismiques forment des « sandwiches » de vingt centimètres d'épaisseur constitués d'une alternance de six couches de caoutchouc et de plaques d'acier. Arrimés à des piliers de béton qui s'élèveront de 1,7 mètre au-dessus du radier de la fosse d'isolation sismique, ces plots de 90 centimètres par 90 soutiendront le radier du complexe tokamak. Ce radier constitue le « plancher » de l'installation. Les trois bâtiments du complexe tokamak reposeront sur des fondations communes. Cette structure monolithique permettra d'éviter que les conduites techniques qui traversent les bâtiments se déplacent les unes par rapport aux autres.

Les travaux d'excavation ont débuté au mois d'août 2010 ; on a extrait 210 000 mètres cubes de terre et de roche pour réaliser la fosse d'isolation sismique. Après avoir creusé le sol sur une profondeur de 17 mètres, les ingénieurs ont réalisé des carottages et des relevés topographiques par radar afin d'établir une carte détaillée du substrat rocheux. Plusieurs petites cavités (« karsts ») ont été détectées et relevées, puis élargies et comblées avec du béton. Les relevés topographiques ont été mis à contribution pour vérifier les hypothèses de conception du complexe tokamak avant de finaliser la conception de la structure.

Durant la phase finale des travaux de terrassement, il a été nécessaire de « meuler » la roche afin d'obtenir une surface parfaitement plane avant de lancer la construction du radier inférieur. La construction des trois bâtiments du complexe tokamak débutera en 2012.