Le Conseil ITER est l'instance dirigeante qui supervise les travaux d'ITER Organization. C'est lui qui nomme les hauts responsables du programme, modifie les règlements, prend les décisions budgétaires et accepte les nouveaux pays et organisations au sein du programme ITER.

Le Conseil ITER se compose de quatre représentants de chaque Membre d'ITER. Son président et son vice-président sont élus parmi les Membres pour un mandat d'une durée maximum de quatre ans. Le Conseil se réunit au moins deux fois par an et publie un communiqué de presse à l'issue de chacune de ces rencontres.

Le Conseil s'appuie sur deux comités consultatifs qui se réunissent dans l'intervalle qui sépare les réunions du Conseil ITER.